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Germán Burgos

Germán se dedica al estudio de la Genética de Poblaciones y Forense, estudio de la proporción de ancestralidad autosómica y de linajes haplotípicos maternos (ADN mitocondrial) y paternos (cromosoma Y) de los diferentes grupos humanos, así como el estudios de diversidad genética de marcadores STRs para identificación humana y criminalística que incluyen STRs autosómicos y de los cromosomas X/Y, diagnóstico molecular
Desarrollo y puesta a punto de sistemas de identificación/filiación basada en STRs para especies animales. Desarrollo de nuevos sistemas de diagnóstico molecular en Humanos y otras especies, en diversas metodologías como: electroforesis capilar: (Secuenciación sanger, análisis de fragmentos y SNaPshot) PCR en tiempo real, LAMP, PCR múltiplex, y desarrollo de servicios basados en Biología Molecular.

Áreas de investigación

  • Genética Forense
  • Genética de Poblaciones
  • Genética Animal
  • Diagnóstico Molecular

Proyectos de Investigación 

  1. Director del proyecto “Epidemiología molecular y estandarización de PCR múltiplex con microsatélites (STRs) para la caracterización molecular y dinámica poblacional del parásito Ascaris spp. aislados de cerdos de zonas rurales del Ecuador” en Colaboración con el grupo de Microbiología del COCyBa de la USFQ, Dirección General de Investigación-Universidad de Las Américas, Nov 2016- Nov 2017. Grant MED.GB.17.05
  2. Director del Proyecto “Estudios de Diversidad Genética y Ancestría en la Población Ecuatoriana”, Dirección General de Investigación-Universidad de Las Américas, May 2017- Nov 2018, Grant MED.GB.17.06
  3. Director del Proyecto “Determinación de frecuencias genotípicas de los transcritos fusión Bcr/Abl mediante un sistema de diagnóstico molecular basado en RT-PCR y electroforesis capilar en pacientes ecuatorianos afectos con leucemia mieloide crónica y aguda del hospital de especialidades Eugenio Espejo de Quito.” Ago 2018 – Ago 2019, Grant MED.GB.18.05.
  4. Director del Proyecto “arquitectura genética de tres grupos étnicos ecuatorianos a la luz de marcadores de linaje uniparental y del cromosoma X”, Dirección General de Investigación-Universidad de Las Américas, Sept 2018- actualmente, Grant MED.GB.18.06.
  5.  Director del Proyecto “Caracterización de la variabilidad genética del caballo criollo paramero Ecuatoriano”, Dirección General de Investigación-Universidad de Las Américas, Feb 2020- actualmente, Grant MED.GBF.20.01.
  6. Director del proyecto “LAMP: Una alternativa diagnóstica versátil de Sars‐Cov19‐2 para laboratorios de baja complejidad”. Sept 2020 – Actualmente. Grant MED.GBF.20.06
  7. Director del Proyecto de doctorado “La proporción de mezcla de los grupos étnicos ecuatorianos vista desde marcadores moleculares del cromosoma X, marcadores informativos de ancestría (AIMs) de tipo indels y marcadores autosómicos tipo SNPs resueltos por espectrometría de masas. Sept 2020 – Actualmente. Grant MED.GBF.20.07

Publicaciones más importantes

• Testing the Ion AmpliSeq™ HID Y-SNP Research Panel v1 for performance and resolution in admixed South Americans of haplogroup Q Forensic Science International: Genetics 59 (2022) 102708
• Investigating genetic diversity in admixed populations from Ecuador. American Journal of Physical Anthropology, 1–11, May, 2021. https://doi.org/10.1002/ajpa.24341
• Paternal and maternal mutations in X-STRs: a GHEP-ISFG collaborative study: Forensic Science International: Genetics 46 (2020) 102258. https://doi.org/10.1016/j.fsigen.2020.102258
• An approach to maternal ancestry in a sample of Ecuadorian “mestizo” population by sequencing the control region of mtDNA: Forensic Science International: Genetics Supplement Series, Volume 7, Issue 1, December 2019, Pages 537-538. https://doi.org/10.1016/j.fsigss.2019.10.081
• A look of paternal ancestry in a sample of Ecuadorian “mestizo” population analyzed through PowerPlex Y23: Forensic Science International: Genetics Supplement Series, Volume 7, Issue 1, December 2019, Pages 534-536. https://doi.org/10.1016/j.fsigss.2019.10.080
• Development of a multiplex real-time PCR surveillance assay for monitoring the health status of Ecuadorian amphibians at risk of extinction: Forensic Science International: Genetics Supplement Series, Volume 7, Issue 1, December 2019, Pages 674-676. https://doi.org/10.1016/j.fsigss.2019.10.134
• New approach to simultaneously identify mitochondrial DNA haplogroups by multiplex PCR-RFLPs and capillary electrophoresis: Forensic Science International: Genetics Supplement Series, Volume 7, Issue 1, December 2019, Pages 528-529. https://doi.org/10.1016/j.fsigss.2019.10.077
• A GHEP-ISFG collaborative study on the genetic variation of 38 autosomal indels for human identification in different continental populations; Forensic Science International: Genetics 2018 Jan; 32:18-25. doi: 10.1016/j.fsigen.2017.09.012. Epub 2017 Sep 22.
• Multiplex PCR in non-human DNA molecular identification of Ascaris spp. In forensic biology; Forensic Science International: Genetics Supplement Series, Volume 6 (2017) e568–e569.
• “A Study of the Molecular Variants Associated with Lactase Persistence in Different Ecuadorian Ethnic Groups” Cesar Paz-Y-Mino, German Burgos, Andres Lopez-Cortes, Camilo Herrera, Anibal Gaviria, Eduardo Tejera, Alejandro Cabrera-Andrade; Am J Hum Biol. 2016, May 6. doi: 10.1002/ajhb.22865
• “Allelic frequencies and forensic parameters for miniSTRs D10S1248, D14S1434 and D22S1045 (NC01) in a sample from Central Andean Colombian region” G. Burgos, T. Restrepo, A. Ibarra, A. Gaviria, G. Machado, C. Mora, R. Lizarazo; Forensic Science International: Genetics Supplement Series 5 (2015) e81–e82.
• “Easy and fast procedure to isolate, purify and immortalize DNA fragments for allelic ladders construction” G. Burgos, T. Restrepo, A. Ibarra, A. Gaviria, G. Machado, C. Mora, R. Lizarazo; Forensic Science International: Genetics Supplement Series 5 (2015) e656–e658.
• “Y STRs mutation events in father-son pairs in Ecuadorian individuals” Forensic Science International: Genetics Supplement Series, Volume 5, December 2015, Pages e310–e311.
• Development of a multiplex system for identifying individuals of Andean Condor (Vultur gryphus) C. Paz-y-Miño, J. Navarrete, M.E. Sánchez, A. Gaviria, P.E. Leone, A. Cabrera-Andrade, A. López-Cortés, G. Burgos; Forensic Science International: Genetics Supplement Series 5 (2015) e228–e230.
• “Evaluating the X Chromosome-Specific Diversity of Colombian Populations Using Insertion/Deletion Polymorphisms” PLoSONE 9(1): e87202, Published: January 31, 2014, DOI: 10.1371/journal.pone.0087202.
• “Comparison of the genetic background of different Colombian populations using the SNPforID 52plex identification panel”, Int J Legal Med. 2014 Jan;128(1):19-25. doi: 10.1007/s00414-013-0858-z. Epub 2013 May 12